Le Grand Orient de France est une fédération de Loges, non une fédération de membres.
Chaque Franc-Maçon est coopté par une Loge qui, elle-même, est affiliée à l'Obédience.

La base de l'exercice des fonctions à l'intérieur de la Loge comme au niveau national de l'Obédience est l'élection, les Loges et l'Obédience fonctionnent de manière totalement démocratique.

Le Président de Loge appelé Vénérable et l'ensemble des autres responsables appelés Officiers parce qu'ils tiennent un Office (Orateur, Trésorier, Hospitalier, etc.) sont élus pour un an par les membres de la Loge appelés Frères, car la Franc-Maçonnerie est une Fraternité.

L'Assemblée Générale annuelle, le Convent, est le législatif de l'Obédience composé d'un délégué par Loge ; elle élit un Conseil de l'Ordre de 33 membres qui est l'Exécutif et une Chambre de Justice qui est le Judiciaire, ces institutions fonctionnant selon le mode de séparation des pouvoirs.

Une institution supplémentaire est la Commission Nationale de Solidarité qui a pour rôle de venir en aide aux Maçons dans le besoin.

Le Conseil de l'Ordre élit en son sein un Bureau dont un Grand Maître qui est le Président national de l'Obédience et la représente seul à l'extérieur.